Òrgan encarregat d’assessorar el Comité de Direcció i a la Direcció General de l’AVAP i d’avaluar el funcionament de l’Agència.
Els membres del Consell Assessor són designats per dos anys, renovables, i han de reunir-se almenys una vegada a l’any. La seua composició és la següent: una o un president expert de reconegut prestigi en avaluació i acreditació de la qualitat universitària, avaluació de programes d’I+D+i i/o prospectiva; tres experts o expertes en avaluació i acreditació de la qualitat universitària, tres experts o expertes en avaluació de programes d’I+D+i, dos experts o expertes en qualitat dels serveis públics i les seues polítiques, i una o un representant del personal tècnic de la *AVAP, que realitza les funcions de secretaria.