El Protocolo de evaluación de las actividades de aseguramiento de la calidad realizadas por la AVAP establece que para la realización de dichas actividades, la AVAP recabará el asesoramiento de la comunidad científica, académica y profesional y para ello se nombrarán las comisiones de evaluación externa de la AVAP, integradas por personal académico de reconocido prestigio, personal experto en sistemas de garantía de calidad, gestión universitaria o Espacio Europeo de Educación Superior, así como por estudiantes universitarios.
El Protocolo establece, asimismo, la composición y funciones de la Comisión de Protocolos y Recursos, que será la responsable de elaborar un informe a petición del Consejo de Universidades, en caso de reclamación por parte de la universidad ante el informe de renovación de la acreditación de títulos universitarios oficiales, o bien en caso de una reclamación por parte de la universidad en el supuesto de verificación de nuevos títulos o seguimiento de títulos existentes.
El Reglamento de Organización y Funcionamiento de la Comisión de Protocolos y Recursos puede encontrarse aquí.